常言道：管理出效益，食用菌技术并不难，食用菌生产“三分技术七分管”。管理不到位很难出效益，世界上最怕“认真”两字，而食用菌生产者一定要认真，在小的细节上马虎不得，否则后果难以想象。
食用菌生产是由市场、资金、技术、管理四大要素组成的，在很大程度上管理起决定性因素，管理中应抓住彻底灭菌和规范化播种，适时放风、温湿控制等，降底污染、科学管理是生产的核心所在，没有污染就有效益。有一种现象，有的生产者将用人计件工资压的很低迫使操作工追求接种数量，忽视起码规范化操作程序，导致成品率下降。用人工资应当采取计件工资和质量工资两部分，完善奖惩制度。
食用菌生产是纯培养，并非像手表组装那样，是无生命东西，手表组装的每一道工序均可进行质量检验，并能及时进行反馈，及时纠正，而食用菌生产需要经过数天时间的培养，才会发现问题，一旦哪个操作环节出现问题，就会造成大批量损失。
如何使熟练员工能安心从事本人工作，也是一门大学问，熟练员工是创造财富的源泉，他们长期工作积累的经验和熟练程度是创造效益的无形资产，对于操作工既要管，要对他们的工作、生活上关心，采用人性化管理，才会真正出效益。